Uno studio su questa "materia oscura" genetica, è stato ripreso da un articolo della rivista Heredity che fa parte del gruppo Nature (https://www.nature.com/articles/s41437-026-00870-5) e poi ripubblicato dalla stampa a livello internazionale (https://muyinteresante.okdiario.com/ciencia/unknome-microbiano-comunicacion-oculta-bacterias.html).
L'articolo è un Perspective paper la cui prima autrice è una giovane postdoc, contrattista di ricerca: Francesca Vaccaro e la senior author una neovincitrice di posto come RTT: Camilla Fagorzi entrambe del Dipartimento di Biologia (UNIFI).
In questo articolo si discute anche con spunti epistemologici, la necessità di indirizzare la ricerca in ambito genetico nella scoperta delle funzioni di una ancora troppo numerosa frazione di geni di cui non conosciamo il ruolo.
Abstract:
Una vasta porzione di geni nei genomi microbici, definita "ignoto", rimane funzionalmente non caratterizzata. Questa "materia oscura" genetica rappresenta un significativo collo di bottiglia in microbiologia, poiché è spesso esclusa dagli studi genomici.
Sosteniamo che una parte sostanziale dell'ignoto codifichi funzioni critiche per le interazioni biotiche, ovvero i complessi dialoghi tra i microbi o tra i microbi e i loro ospiti.
Queste funzioni sono raramente osservate in condizioni di laboratorio standard, che si basano su colture pure semplificate.
Svelare l'ignoto richiede quindi una maggiore enfasi su sistemi sperimentali ecologicamente rilevanti. Abbracciando la complessità attraverso la co-coltura e le analisi in situ, possiamo iniziare a decifrare questo repertorio genetico nascosto, approfondendo la nostra comprensione della comunicazione, dell'adattamento e dell'evoluzione microbica.
Le sfide concettuali e metodologiche sollevate dall'ignoto microbico hanno una risonanza che va ben oltre la microbiologia: frazioni "oscure" parallele di geni e proteine non caratterizzati pervadono i genomi eucariotici, dai geni orfani (specifici di una linea evolutiva) che sono alla base delle novità in piante e animali, compreso l'uomo.
Adottare approcci ecologici e a livello di sistema per dissezionare l'ignoto microbico ha quindi il potenziale di ridefinire il modo in cui colleghiamo il genotipo al fenotipo in sistemi biologici dipendenti dal contesto e guidati dalle interazioni.
Per saperne di più vai al link di Nature.com